
近日,英国剑桥大学的遗传学专家在《美国国家科学院院刊》上发表了一篇研究,提出了新冠病毒并非起源于武汉的观点。
这篇研究题为“Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes”,即SARS-CoV-2基因组的系统发育网络分析。
这些基因组紧密相关,在人类宿主的进化选择下,有时伴随着平行的进化事件,即相同的病毒突变出现在两个不同的人类宿主中。
这使得基于特征的系统发育网络成为在人类宿主中重建其进化路径和祖先基因组的选择方法。
这种网络方法已被用于大约10,000种不同生物的系统发育研究,主要用于重建史前人类的人口流动和生态研究,但在病毒学领域应用较少。
在对160个完整的SARS-Cov-2 (SARS-Cov-2)人类冠状病毒(SARS-Cov-2)基因组的系统发育网络分析中(见图1),研究人员发现了三个以氨基酸变化区分的中心变异,将其命名为A、B和C,根据蝙蝠群冠状病毒,A是祖先型。
A型和C型(B型的变异类型)在东亚以外的地区,即欧洲和美国,有相当大的比例。
相比之下,B型是东亚最常见的类型,A型并不是武汉的主要病毒类型,武汉只有少数的该病毒类型患者。
“由于我们没有掌握很多早期样本,在确定病毒源地的时候需要谨慎一些。”他说,“在我看来,我们不应该局限在武汉。”
这份研究表明,病毒最初的成功传播可能早在2019年9月13日就开始了,这一可能性达到95%。在12月1日中国报告首例病例之前,新冠病毒可能已经在人类和动物中传播。